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刘昭麟、金观涛、刘青峰、邱伟云、姚育松：〈自然语言处理技术于中文史学文献分析之初步应用〉，收入项洁等主编：《数位人文要义：寻找类型与轨迹》（台北：台湾大学出版中心，2012年11月），页61‒82。 ISBN：978-986-03-4236-9。
邱伟云：〈疾病图谱、医者想像、公共參与：试論《点石斋画报》中民间宗教之文化展演〉，收于政治大学文学院编：《陈百年先生学术论文奖论文集》【第八期】（台北：政治大学，2012），页113-138。 ISBN：978-986-03-1776-3。
邱伟云：〈文化他者、宗教他者与庶民他者──論晚清《点石斋画报》（1884-1898 年）中佛教形像的三重建构〉，收于高雄师范大学国文系编：《鹤山 21 世纪国际论坛宗教论坛论文集》（台北：普音文化事业公司，2011年6月）。ISBN 978-957-95-4788-8。
邱伟云：〈关键词丛与文本意义挖掘的尝试：以《清季外交史料》为例〉，收入项洁等主编：《数位人文在历史学研究的应用》（台北：台湾大学出版中心，2011），页159-188。ISBN：978-986-03-0163-2。
